巴达维亚城的血战一直持续到第二天的下午时分，整个巴达维亚城都化身地狱，城池内外到处都是尸体和鲜血，城内的荷兰人几乎全部被杀，考文斯从荷兰本土带来的一千精锐火枪手、五千火枪手、两千龙骑兵纵然战力强悍，但也不是数万杀红眼的土人大军的对手。
此战，近万荷兰大军全军覆没，考文斯连同城内的荷兰将领、贵族、传教士，以及一千多名妇孺全部被杀，张骁军和严虎还想要抓一些俘虏送回国内献俘，但当二人率部进城之后，视力所及只有尸体而已。
而城内的四万多土人大军也是伤亡巨大，两万三千多人被杀，剩下的土人士兵也是精疲力竭，根本没有什么抵抗就束手就擒，被依附天策军的六万土人大军团团包围，等候张骁军和严虎的发落。
张骁军和严虎率部在巴达维亚城内巡视一番之后，眼见此处经过大战已经残破不堪，而且杀戮太重，已经不适合当做大明在吕宋岛的首府驻地了。
回到明军大营之后，二人一面率部看管俘虏、稳定吕宋岛的局势，一面向国内报捷，并且向刘君韬请示下一步的命令。
成化六年五月，刘君韬终于接到了前方送来的捷报，得知盘踞在巴达维亚城的荷兰势力被连根拔起，刘君韬喜出望外，当即向成化帝报捷。
同时，刘君韬经过深思熟虑之后，便命令张骁军和严虎率军在巴达维亚城周边修建一座城池，就命名为南华城，作为大明帝国在吕宋岛的大本营和首府。
对于张骁军、严虎在捷报中询问的，如何处置数万土人俘虏、六万土人大军的问题，刘君韬直接回复道“数万土人俘虏助纣为虐，即便有阵前倒戈之举，也是迫于无奈，并无归降华夏之心，尽快予以处决！”
对于六万土人大军，刘君韬则是恩威并施，回复道“六万土人大军即刻进行整编，朝廷会陆续向吕宋岛进行移民实边，并且调集驻军防守，这六万大军便作为仆从军使用。要对其进行严苛操练，不服从命令者，格杀勿论！”
刘君韬并不是圣母，对于落后的民族而言，大明根本没有必要滥发慈悲，没有像荷兰人那样随意屠杀、虐待吕宋岛的土人，就已经是最大的仁慈了。
张骁军和严虎在接到刘君韬的命令之后，立即开始执行命令，先是将巴达维亚城一把火全部烧毁，同时就在熊熊大火旁边，将剩下的将近两万多土人俘虏全部斩杀，当然动手行刑的都是那些依附大明的土人士兵，这权当是纳投名状了。
而后，张骁军和严虎便驱使那六万大军以及十余万土人部落族众，在原巴达维亚城以东十余里的平原上修筑新城，这里距离海港很近，只有数里而已，而且土地肥沃、地势平坦，非常适合筑城，这里将会是吕宋岛的首府南华城所在地！
至于天策军各部何时回国，暂时刘君韬并没有下达命令，而是需要等到朝廷从国内调集驻军过来之后再行考虑。